محمد نبی حبیبی درباره شخصیت ایشان اظهار داشت: به یاد دارم در زمان معرفی کابینه شهید رجایی به حضرت امام خمینی (ره) ایشان در توصیف شخصیت آیت الله مهدوی کنی گفتند "ما نسبت به آیت الله مهدوی ارادت داشته‌ایم، داریم و خواهیم داشت" که این مسئله نشان دهنده اطمینان قلبی بنیانگذار انقلاب اسلامی نسبت به آینده آیت الله مهدوی کنی بود.